La aventura de nuestro simpático animalito comienza con unas vacaciones en la playa junto a sus amigos, de repente un misterioso dirigible aparece de la nada. A su mando se encuentra el terrible, y clásico enemigo de Crash, Neo Cortex quien lanza un par de jaulas y apresa sus amigos la máscara Aku Aku y Coco, por lo que al valiente marsupial no le queda otra que lanzarse a su rescate a través de exóticos y frondosos escenarios repletos de dificultades.