Pariah comienza cuando el personaje que controlas, Dr. Jack Mason, es encargado con la misión de escoltar una paciente infectada por un virus mortal a territorio hostil. Como no podía ser de otra manera la aventura empieza al estrellarse la nave en la que viajas y sorprendentemente sólo sobreviven Mason, su ayudante, y la paciente infectada. A partir de ahora te enfrentarás a hordas de criminales, a la vez que buscas a la mujer portadora. A través de múltiples escenas de video se nos irá narrando la historia y probablemente a más de uno le sorprenda el excesivo uso de lenguaje adulto.